昌吉回族自治州从东西北三面环抱首府乌鲁木齐市，地处天山北坡经济带和乌昌石城市群率先发展的核心区域，是建设新疆丝绸之路经济带核心区的重要组成部分。州府昌吉市距乌鲁木齐市中心35公里，距乌鲁木齐国际机场18公里。G312、G216、G7等高速公路贯穿全境，是东联内地、西接中亚和欧洲市场的桥头堡和黄金通道。
全州辖5县（玛纳斯县、呼图壁县、吉木萨尔县、奇台县、木垒哈萨克自治县）、2市（昌吉市、阜康市）、3个国家级园区（新疆准东经济技术开发区、昌吉高新技术产业开发区、昌吉国家农业科技园区）。驻有新疆生产建设兵团第六师和第八师部分团场21个。
截至2020年11月1日零时，昌吉回族自治州常住人口为1613585人。
2022年，昌吉回族自治州实现地区生产总值（GDP）2169.52亿元。